Pablo VI también conoció personalmente a Conchita en enero de 1966, en una breve audiencia, inesperada y semi-privada, con su madre y el P. Luna. En la audiencia Conchita probablemente le transmitió la fecha que conocía del Milagro, como lo hizo con el cardenal Ottaviani en aquel viaje. Pablo VI le dijo: Conchita, Yo te bendigo y conmigo te bendice toda la Iglesia. De Pablo VI es también este comentario: Es la historia mas hermosa de la humanidad desde el Nacimiento de Cristo. Es como la segunda Vida de la Santísima Virgen en la tierra y no hay palabras para agradecerlo.
Por último, el Papa Pablo VI concedió la Bendición Apostólica a la Obra de difusión de los Mensajes de Garabandal el 12 de Junio de 1967. En una Audiencia dada al Padre Javier Escalada S.J, este comentaba al Papa que había mucha oposición a creer en las apariciones de Garabandal. Pablo VI le cortó y dijo: No importa, diga a esas gentes que es el Papa quién desea se hagan públicos esos Mensajes y a la mayor urgencia